Em Gái Của Bạn Tôi Đang Chọc Tức Tôi là câu chuyện xoay quanh cuộc sống của học sinh trung học Akiteru Oboshi. Với Akiteru, những trải nghiệm tuổi trẻ như vui chơi, tình bạn, hay thậm chí là có bạn gái, đều chỉ là lãng phí thời gian.
Akiteru cảm thấy cuộc sống của mình khá thoải mái cho đến khi em gái của bạn thân, Iroha Kohinata, xuất hiện và liên tục trêu chọc cậu. Iroha hầu như sống trong phòng của Akiteru, luôn nằm trên giường cậu và trở thành một cơn bão bám dính không dứt.
Điều khiến Akiteru phiền toái là Iroha chỉ trở nên khó chịu khi ở cạnh cậu. Sự hiện diện của cô em gái khiến cuộc sống của Akiteru bị đảo lộn, và cậu bắt đầu tự hỏi tại sao Iroha lại như vậy. Liệu Akiteru có tìm cách giải quyết vấn đề này không, hay cậu sẽ phải chấp nhận sự phiền toái từ cô em gái của bạn thân?